Stage d’initiation au traitement des données et analyses statistiques (4-5/10/2021)

Stage organisé dans le cadre de l’opération 1 du GDR BioArchéoDat. Animé par Rémi Berthon (AASPE), sur deux journées indépendantes l’une de l’autre. Lieu : salle de conférence de géologie, 43 rue Buffon 75005 Paris. Dates et horaires : lundi 4 octobre (9h30-16h30) et mardi 5 octobre (9h30-16h30).

Présentation

Formation aux fondamentaux accessible à toutes et tous. Le plus est la prise en main du logiciel PAST qui permet d’accéder simplement à de nombreuses analyses. Pour les analyses multivariées, initiation à R en passant par des interfaces (il n’est pas nécessaire de maitriser le langage R).

Programme

Lundi 4 octobre : Traitement de données quantitatives discrètes (dénombrement, comptage. Par exemple spectres)

• Utilisation de l’outils « tableau croisé dynamique » pour réaliser des tableaux de comptage automatiques
• Présentations graphiques sous LibreOffice et PAST
• Comparaison de deux assemblages : Chi2
• Précision des pourcentages
• Comparaison de plusieurs assemblages avec 3 variables : diagrammes ternaires
• Comparaison de plusieurs assemblages avec plusieurs variables : Analyse Factorielle des Correspondances (avec R ou PAST)
• Analyse de tableau de données de type « présence-absence »
• Analyse de tableau de données qualitatives (description de critères)

Mardi 5 octobre : Traitement de données quantitatives continues (mesures)

• Exploration d’un jeu de données, test de la normalité, de la variance.
• Construction d’un histogramme sur PAST
• Analyse des mélanges
• Liens entre deux variables. Corrélation, régression.
• Analyse de plusieurs individus décrits par plusieurs variables quantitatives continues : Analyse en Composante Principale (avec R ou PAST)

Logiciels à installer avant la formation

Tableur : vous pouvez utiliser Microsoft Excel si vous l’avez. Cependant, nous travaillerons avec LibreOffice Calc (https://fr.libreoffice.org/download/telecharger-libreoffice/). Téléchargez ou mettez à jour la version 6.4.7 (deuxième choix de la page de téléchargement).

Logiciel PAST version 4.04 : à télécharger sur le site (https://www.nhm.uio.no/english/research/infrastructure/past/).
Télécharger le manuel. Logiciel Triangle.graph (ne fonctionne peut-être pas sous certaines versions de Mac). Télécharger ici : http://paleoanthropology.ucdavis.edu/uploads/5/7/8/5/57851985/triangle_2.0.zip.

R et RStudio : Télécharger et installer R (https://cran.rstudio.com/). Télécharger et installer RStudio à cette adresse
https://rstudio.com/products/rstudio/download/ (« RStudio Desktop Free » version 1.3.1093). Dans RStudio aller dans « Tools » « Install Packages » et installer les package suivants : FactoMineR, Factoshiny, FactoInvestigate.

Contacts formation

Pour des questions sur le contenu de la formation : remi.berthon@mnhn.fr, avec copie à salavert@mhn.fr et callou@mnhn.fr. Pour les missions (hors Inrap) : bernadette.gein@misha.fr.

Inscription

Si cette formation vous intéresse (ou l’un de vos étudiants), merci d’envoyer un courriel à Aurélie Salavert (salavert@mnhn.fr) et Cécile Callou (callou@mnhn.fr), avec copie à Rose-Marie Arbogast (rose-marie.arbogast@misha.fr).

NB : Ce stage est accessible aux agents de l’Inrap rattachés à une UMR, membre du GDR et bioarchéologues (demande de congés formation auprès de la DRH).

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